Output organizzato per analisi: cartella input/, output/<csv>/ con domini, sovrapposizione e report

- dati/ rinominata input/ (CSV ignorati, cartella tracciata con .gitkeep)
- lavoro/ sostituita da output/<nome csv>/{01_domini,02_sovrapposizione,03_report}
- report.md con indice, tabella equazioni e immagini incorporate
- sovrapposizione complessiva dati-equazioni per serie

Co-Authored-By: Claude Sonnet 5.5 <noreply@anthropic.com>

docs/SPEC.md

@@ -5,11 +5,13 @@
 ## 1. Flusso
 
 ```
-CSV ─► [DOMINI] gradini ⇒ riposo | riscaldamento… | raffreddamento ─► lavoro/domini.toml (modificabile), proposta.png
+CSV ─► [1 DOMINI] gradini ⇒ riposo | riscaldamento… | raffreddamento ─► output/<csv>/01_domini/ (domini.png, domini.toml modificabile)
         ▼
-       [FIT] per (dominio, serie): modelli del tipo ─► regola di scelta ─► lavoro/out/report.md, risultati.json, dominio*_*.png
+       [2 FIT] per (dominio, serie): modelli del tipo ─► regola di scelta ─► 02_sovrapposizione/ (dati contro equazioni)
+        ▼
+       [3 REPORT] 03_report/report.md (immagini incorporate) e risultati.json
 ```
-Tutto il calcolo è deterministico (nessuna partenza casuale, nessun LLM).
+Tutto il calcolo è deterministico (nessuna partenza casuale, nessun LLM). Ogni CSV ha la sua cartella `output/<nome csv>/`.
 
 ## 2. Domini (`domini.py`)
 
@@ -51,14 +53,16 @@ Scarta non convergenti, con parametri a limite o non identificabili. Se esistono
 
 | Comando | Funzione |
 |---|---|
-| `fitseg domini CSV` | propone i domini: tabella, `lavoro/domini.toml`, `lavoro/proposta.png` |
-| `fitseg analizza CSV [--domini FILE]` | domini (proposti o da FILE) + fit + `lavoro/out/{report.md, risultati.json, dominio<k>_<serie>.png}` |
+| `fitseg domini CSV` | passo 1: tabella, `01_domini/domini.png`, `01_domini/domini.toml` (nessun fit) |
+| `fitseg analizza CSV [--domini FILE]` | tutti i passi; con `--domini` usa i domini corretti a mano al posto della proposta |
 
-Opzioni globali prima del sottocomando: `--config PATH`, `--lavoro DIR`. Exit: 0 ok · 3 config non valida · 4 CSV illeggibile · 6 domini non validi.
+File in `output/<csv>/`: `01_domini/{domini.png, domini.toml}` · `02_sovrapposizione/{sovrapposizione_<serie>.png, dominio<k>_<serie>.png}` · `03_report/{report.md, risultati.json}`. Il report (indice: 1 suddivisione, 2 equazioni, 3 sovrapposizione, 4 dettaglio per dominio) incorpora le immagini con percorsi relativi.
+
+Opzioni globali prima del sottocomando: `--config PATH`, `--output DIR` (default `[output] cartella_output`). Exit: 0 ok · 3 config non valida · 4 CSV illeggibile · 6 domini non validi.
 
 ## 6. Test
 
-Unitari su un segnale sintetico (`tests/conftest.py`: τ = 16 s, 3 gradini, nessun disturbo a salto) e di integrazione su `dati/gen_{1,2,3}.csv` (saltati se mancano). Dettaglio: README, «Test». Coperto: domini (3, 0, 1 gradino, sotto soglia, confini), recupero di τ/`c`/`A`, parametri fissi e ereditati dal raffreddamento, regola di scelta, errori di config/CSV/`domini.toml`, CLI.
+Unitari su un segnale sintetico (`tests/conftest.py`: τ = 16 s, 3 gradini, nessun disturbo a salto) e di integrazione su `input/gen_{1,2,3}.csv` (saltati se mancano). Dettaglio: README, «Test». Coperto: domini (3, 0, 1 gradino, sotto soglia, confini), recupero di τ/`c`/`A`, parametri fissi e ereditati dal raffreddamento, regola di scelta, errori di config/CSV/`domini.toml`, CLI.
 
 ## 7. Limiti noti