docs: aggiorna CLAUDE.md e README secondari per rispecchiare architettura attuale
Rimuove riferimenti a Stage 1/Stage 2, md_optimizer.py, fix_chunks.py, --skip-optimize, _clean.md e _content_list_v2.json (tutti obsoleti). Aggiorna pipeline diagram, comandi, tabella architettura e input MinerU. Co-Authored-By: Claude Sonnet 4.6 <noreply@anthropic.com>
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@@ -43,7 +43,7 @@ EMBED_MODEL = "nomic-embed-text" # ← cambia qui
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# Vettorizza un singolo documento
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.venv/bin/python ingestion/ingest.py --stem <nome>
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# Vettorizza tutti i documenti trovati in step-6/
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# Vettorizza tutti i documenti trovati in chunks/
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.venv/bin/python ingestion/ingest.py
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# Sovrascrive una collection già esistente
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