Ingest della tesi: concetti, composti, tecniche, difetti noti e bibliografia

- Aggiunge 10 pagine concetto, 5 composti e 6 tecniche, riorganizzate per argomento con tesi_loc e righe di raw/tesi.md
- Incorpora le figure (embed e link alle note) nelle pagine pertinenti
- Aggiunge overview, mappa wiki/tesi.md, difetti-noti (incoerenze rilevate) e bibliografia generata (scripts/gen_bibliografia.py)
- Rigenera le note figura con avviso per caption_mismatch; aggiorna CLAUDE.md, index.md e log.md

Co-Authored-By: Claude Sonnet 5.5 <noreply@anthropic.com>
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@@ -32,10 +32,11 @@ Convenzioni di `tesi.md`: decimali con la virgola; codici composto con il punto
CLAUDE.md index.md log.md
raw/ immutabile (vedi sopra)
scripts/gen_figures.py genera wiki/figures/ da raw/immagini.json
scripts/gen_bibliografia.py genera wiki/bibliografia.md da raw/bibliografia.json
wiki/
overview.md sintesi evolutiva, research question, risultati
tesi.md mappa capitolo/sezione → pagine wiki (unica pagina "source" della tesi)
bibliografia.md i 59 riferimenti raggruppati per tema, con link alle schede raw/fonti/
bibliografia.md i 59 riferimenti (GENERATA dallo script), con link alle schede raw/fonti/
concepts/ meccanismi, ROP, ACQ, bottle brush, π-stacking, ciclovoltammetria…
compounds/ un file per composto numerato (composto-32.md) o polimero/campione
techniques/ NMR, FT-IR, GPC, UV-Vis, fluorescenza, DSC, CV: condizioni usate nella tesi
@@ -72,11 +73,16 @@ status: draft | stable
- **Sicurezza:** niente procedure di sintesi pericolose oltre quanto riporta la tesi; riporta i pericoli noti dei reagenti se citati.
## Figure
- `wiki/figures/*.md` sono **derivate**: `python scripts/gen_figures.py` le rigenera da `raw/immagini.json`, riportando ogni campo (didascalie, descrizioni e testo visibile per pannello, composti, concetti, contesto, righe di citazione, note di revisione) senza riassumere. Eccezione alla regola "solo l'LLM scrive in `wiki/`"; non modificarle a mano, correggi `raw/immagini.json` solo se l'utente lo chiede e poi rigenera.
- `wiki/figures/*.md` e `wiki/bibliografia.md` sono **derivate**: `python scripts/gen_figures.py` le rigenera da `raw/immagini.json`, riportando ogni campo (didascalie, descrizioni e testo visibile per pannello, composti, concetti, contesto, righe di citazione, note di revisione) senza riassumere. Eccezione alla regola "solo l'LLM scrive in `wiki/`"; non modificarle a mano, correggi `raw/immagini.json` solo se l'utente lo chiede e poi rigenera.
- **Attendibilità:** solo `caption_printed` è testo della tesi. Descrizioni, `visible_text` e didascalia generata derivano dall'immagine e non sono verificati: valori letti da grafici o schemi (rese, picchi, potenziali) vanno confermati sull'immagine/tesi prima di riusarli.
- Le pagine concept/compound/technique richiamano le figure con `[[fig-026]]` o con l'embed `![[immagini/<file>]]` (da `panels[].embed`). Le figure con `flags` o `review_notes` (Figure 26, 27, 29, 57, 62, 65, 66, 68 hanno discrepanze didascalia/testo) vanno citate con l'avvertenza.
- `compounds` nel catalogo sono numeri della tesi; `concepts` sono slug candidati, non nomi definitivi: crea la pagina solo se la regola dei ≥2 usi è soddisfatta.
## Regole di organizzazione dei dati
- Una tabella o un dato sta in **una sola pagina**: quella dove la tesi lo discute (per es. Tab. 5 in `dpp-2`, Tab. 13-14 in `ciclovoltammetria`). Le altre pagine rimandano con wikilink; fanno eccezione i riepiloghi comparativi (es. in `uv-vis-fluorescenza`), che citano la tabella di origine.
- Le pagine riorganizzano per argomento, non per capitolo, senza eliminare informazioni: procedure con quantità in tabella, condizioni, assegnazioni e ragionamenti della tesi restano, con `tesi_loc` e righe.
- Composti sperimentali: `dpp-1`, `dpp-2`, `copolimeri-3a-3b-3c`, `bottle-brush-3-x`. La numerazione dei composti del cap. 1 (1-48) è un'altra: non confonderle.
## Difetti noti della tesi
Raccolti in `wiki/analyses/difetti-noti.md` (una sola pagina; le altre rimandano lì): bibliografia con voce 44 duplicata della 1; voci 20, 22, 36, 53 incomplete; DOI errati nelle voci 47, 48 (corretto 10.1080/15583720802231833) e 49; voci 47, 49, 53 non identificabili; segnaposto "paragrafo XX (XX)" in 4.4.4; discrepanze figura/testo sopra elencate.